המועצה האזורית עמק חפר פועלת באופן מקיף ותמידי לשיפור איכות החיים והסביבה – בעשייה סביבתית, בפיקוח ובהגברת המודעות לנושאים אקולוגיים שונים ביישובים ובמוסדות החינוך האזוריים.
המועצה הינה מהרשויות המובילות במדינה בתחום הפרדת פסולת למיחזור, כמו גם בתחומים סביבתיים נוספים; מחלקת איכות הסביבה פועלת בנושאים כגון שימור ערכי הטבע והנוף בעמק חפר בשיתוף מתנדבים ותושבים בקהילה, מיצוב החקלאות, פיתוח אתרים ופארקים טבעיים, עריכת תוכנית רב-שנתית בנושאי קיימות - מגני הילדים ועד לבתי הספר התיכונים ועוד.
מחלקת איכות סביבה וקיימות מטפלת בנושאים הבאים:
- הפרדת פסולת למיחזור ופינוי פסולת
- טיפול במפגעים סביבתיים
- ניקיון הפארקים ושטחים פתוחים
- פיקוח הדברת מזיקים
- קישור בין המועצה למשרד הגנת הסביבה בנושאים של זיהום אוויר, מים, רעש ומפגעי סביבה אחרים
- בדיקות מי שתיה בכל היישובים
- בדיקת מי הים והבריכות בעונת הרחצה
- ביקורת בעסקי מזון
- אספקת המים בשכונות ובאזור התעשייה
- מתן ייעוץ והדרכה ליישובי המועצה
- חינוך והסברה במערכת החינוך בנושאי קיימות מגוונים
- טיפוח מערך מתנדבים "ירוקים"
- מידע סביבתי - תקנות חופש המידע